Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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