Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ccdc17Q8CE13 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc17Q8CE13 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc17Q8CE13 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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