Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms