Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg9aQ68FE2 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms