Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Siah1bQ06985 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms