Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grin2bQ01097 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms