Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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