Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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