Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.1 ms