Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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