Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Sfi1-201ENSMUST00000066391 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Helb-201ENSMUST00000020449 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms