Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms