Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm2056J3QQ02 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2056J3QQ02 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms