Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm26601-201ENSMUST00000181427 3551 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 C1ra-201ENSMUST00000068593 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Smim18J3QNP2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms