Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms