Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Smg9Q9DB90 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smg9Q9DB90 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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