Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Usp12Q9D9M2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Usp12Q9D9M2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Usp12Q9D9M2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Usp12Q9D9M2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Usp12Q9D9M2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Usp12Q9D9M2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms