Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Tnip3-208ENSMUST00000212402 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Rhox1-201ENSMUST00000115210 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm8257-203ENSMUST00000179215 489 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca7Q9D0M2 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms