Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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