Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms