Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms