Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp398Q8BV16 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp398Q8BV16 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp398Q8BV16 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp398Q8BV16 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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