Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdca8Q8BHX3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdca8Q8BHX3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms