Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Crb2Q80YA8 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Crb2Q80YA8 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Crb2Q80YA8 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crb2Q80YA8 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 486.5 ms