Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssxb3Q6XAS4 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssxb3Q6XAS4 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssxb3Q6XAS4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssxb3Q6XAS4 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ssxb3Q6XAS4 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ssxb3Q6XAS4 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ssxb3Q6XAS4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ssxb3Q6XAS4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ssxb3Q6XAS4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ssxb3Q6XAS4 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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