Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg9bQ6EBV9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms