Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nop58Q6DFW4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nop58Q6DFW4 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nop58Q6DFW4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms