Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tdrd5Q5VCS6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms