Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms