Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms