Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Bfar-202ENSMUST00000069281 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Stx12-201ENSMUST00000030698 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccbe1Q3MI99 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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