Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah1bQ06985 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms