Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GscQ02591 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GscQ02591 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GscQ02591 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms