Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2bQ01097 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms