Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr1bP70700 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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