Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tra2bP62996 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms