Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Nell1-202ENSMUST00000107603 2756 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Sh3rf1-202ENSMUST00000209611 4416 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cyp2d22-201ENSMUST00000023083 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Mapk6-201ENSMUST00000049355 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Fam110b-202ENSMUST00000108380 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm15455-201ENSMUST00000117459 2557 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sem1P60897 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sem1P60897 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sem1P60897 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sem1P60897 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 A3galt2-201ENSMUST00000030585 3390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Nrf1-205ENSMUST00000115200 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cd200-202ENSMUST00000163230 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sem1P60897 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Smoc1-203ENSMUST00000129362 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sem1P60897 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Timeless-205ENSMUST00000105244 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Sem1P60897 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Rpa1-201ENSMUST00000000767 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sem1P60897 Mis18bp1-201ENSMUST00000052201 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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