Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmod1P49813 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms