Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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H2-Eb1P04230 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-Eb1P04230 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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