Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01638 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01638 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01638 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01638 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01638 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P01638 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01638 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P01638 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms