Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lnx1O70263 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms