Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lhx8O35652 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Lhx8O35652 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 AC133598.3-207ENSMUST00000225918 704 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Cbwd1-201ENSMUST00000025815 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lhx8O35652 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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