Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms