Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms