Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SrfQ9JM73 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SrfQ9JM73 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SrfQ9JM73 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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