Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp12Q9D9M2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp12Q9D9M2 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms