Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifi35Q9D8C4 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifi35Q9D8C4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms