Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cldn22Q9D7U6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn22Q9D7U6 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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