Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otud1Q9CUB6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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