Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp2Q9CQ73 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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